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Società Italiana di Medicina di Emergenza e Urgenza Pediatrica

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Società Italiana di Medicina di Emergenza e Urgenza Pediatrica

Un approccio multiplex-NGS per identificare i virus respiratori a RNA durante la pandemia di COVID-19

Marzo 27, 2023 by adminspml

È stato implementato un approccio metodologico basato sulla PCR multiplex di trascrizione inversa (Reverse Transcription, RT) seguita dal sequenziamento di nuova generazione (Next-Generation Sequencing, NGS) per identificare contemporaneamente più virus respiratori a RNA.

È stato analizzato un campionamento di convenienza dalla sorveglianza respiratoria e dalla diagnosi di SARS-CoV-2 nel 2020 e nel 2021 a Montevideo, in Uruguay.

I risultati hanno rivelato la cocircolazione di SARS-CoV-2 con

  • Rinovirus umano (human RhinoVirush, hRV) A, B e C,
  • Virus respiratorio sinciziale umano B (human Respiratory Syncytial Virus, hRSV),
  • Virus dell’influenza A e
  • Metapneumovirus B1.

Negli adulti e/o nei bambini sono state identificate coinfezioni da SARS-CoV-2 con hRV o hRSV B e coinfezioni da virus dell’influenza A con hRV C.

Questa metodologia combina i vantaggi dell’amplificazione genomica multiplex con la sensibilità e le informazioni fornite da NGS.

Un vantaggio è che possono essere incorporati bersagli virali aggiuntivi, rendendolo uno strumento utile per studiare la cocircolazione e le coinfezioni dei virus respiratori in contesti pandemici e post-pandemia.

Arch Virol. 2023 Feb 14;168(3):87.                                                         Leggi l’articolo (FREE)

A multiplex-NGS approach to identifying respiratory RNA viruses during the COVID-19 pandemic

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